Vértices dominantes en redes reguladoras de genes y sus paisajes de atractores

Ponente(s): Andrea Arlette España Tinajero, Edgardo Ugalde Saldaña

Dentro de esta plática, se explora la relación entre el conjunto de vértices dominantes en las redes reguladoras de genes en el desarrollo (dGRN) y su respectivo paisaje de atractores. Una red reguladora es un sistema dinámico que involucra varias unidades interconectadas, cuya regla dinámica está determinada por la topología de la red subyacente. Las unidades que interactúan (en este caso, corresponden a los genes) tienen un valor binario en cada paso de tiempo. Recopilamos 20 redes de la literatura, que representan a 11 organismos. La muestra contiene estudios en anfibios, ascidias, aves, bacterias, equinodermos, insectos, nematodos, mamíferos y plantas, los cuales se dividieron en dos grupos. Para el Grupo 1, el diagrama de transición de las dGRNs fue calculado completamente debido a la baja dimensionalidad exhibida por estas redes. Por otro lado, para el Grupo 2, se utilizó un conjunto de condiciones iniciales aleatorias para muestrear la dinámica de cada red. Se presenta una caracterización de los diagramas de transición encontrados y la importancia del papel de los vértices dominantes para su estudio.